Škola vyučuje podle vzdělávacího programu Škola na cestu životem s povinným předmětem náboženská výchova, kterou vyučují na I. stupni paní učitelky s potřebnou aprobací a na II. stupni kněží – salesiáni zlínské farnosti, což je velmi vhodné pro získání kontaktu mezi nimi a dětmi. Od třetího ročníku je vyučován anglický jazyk a od sedmého ročníku jazyk německý. Žáci se také pravidelně účastní ve druhém a třetím ročníku kurzů plavání.

Za hlavní cíl výchovně vzdělávacího procesu si škola klade co nejkvalitnější výuku všech vyučovacích předmětů. Výuka musí být vzhledem k širokému profilu schopností a nadání žáků  uzpůsobena tak, aby neponižovala žáky slabší a byla jim věnována dostatečná péče v rámci individuálního vzdělávacího plánu, ale také tak, aby se žákům nadprůměrným dostalo dostatečné péče (zapojení do soutěží, olympiád apod.). Třídy jsou testovány v hlavních předmětech prostřednictvím srovnávacích testů SCIO a NIQES, do kterých jsou zapojeny školy v rámci celé České republiky.